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深谷肇一

FUKAYA Keiichi

氏名: 深谷肇一（ふかやけいいち）

所属／職名: 生物多様性領域（生物多様性評価・予測研究室）／主任研究員

個別研究課題

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研究成果（誌上）

all
査読付き原著論文
総説・解説
書籍

査読付き原著論文
The scale-variant interstage flow makes biological insights possible: A response to Hinrichsen

発表者 : Yokomizo H.(横溝裕行), Fukaya K.(深谷肇一), Lambrinos J.G., Takada T.
掲載誌 : Journal of Ecology, 113(6):1458-1460 (2025)
査読付き原著論文
Changes of cyprinid fishery resources in Lake Biwa over 57 years: association with multiple stressors and restoration measures

発表者 : Matsuzaki S.(松崎慎一郎), Fukaya K.(深谷肇一), Mabuchi K.(馬渕浩司), Kikkko T., Takamura N.
掲載誌 : Oecologia, 207(121): (2025)
査読付き原著論文
occumb: An R package for site occupancy modeling of eDNA metabarcoding data

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一), Hasebe Y.
掲載誌 : Population Ecology (2025)
査読付き原著論文
Optimizing Environmental DNA Metabarcoding of Archived Suspended Particulate Matter for River Biodiversity Monitoring

発表者 : Schütz R., Fukaya K.(深谷肇一), Beermann A.J. , Díaz C., Lenz A.-C., Macher T.-H., Koschorreck J., Leese F.
掲載誌 : Environmental DNA, 7(4):e70130 (2025)
査読付き原著論文
Bayesian state-space synthetic control method for deforestation baseline estimation for forest carbon credits

発表者 : Takahata K., Suetsugu H., Fukaya K.(深谷肇一), Shirota S.
掲載誌 : Environmental Data Science, 3:e6 (2024)
査読付き原著論文
Interstage flow matrices: Population statistic derived from matrix population models

発表者 : Yokomizo H.(横溝裕行), Fukaya K.(深谷肇一), Lambrinos J.G., Kawai Y., Takada T.
掲載誌 : Journal of Ecology, 112:1326-1338 (2024)
査読付き原著論文
Albatrosses employ orientation and routing strategies similar to yacht racers

発表者 : Goto Y., Weimerskirch H., Fukaya K.(深谷肇一), Yoda K., Naruoka M., Sato K.
掲載誌 : Proceedings of the National Academy of Sciences, 121(23):e2312851121 (2024)
書籍
−

発表者 : 深谷肇一
掲載誌 : 生態学のための標本抽出法 (2023)
査読付き原著論文
UAV-based height measurement and height-diameter model integrating taxonomic effects: exploring vertical structure of aboveground biomass and species diversity in a Malaysian tropical forest

発表者 : Takeuchi Y.(竹内やよい), Borjigin H., Niiyama K., Sato T., Fukaya K.(深谷肇一), Okuda T., Hayashi M. , Omar H., Norizan A.M.
掲載誌 : Environmental Research: Ecology, 2(3): (2023)
総説・解説
Biodiversity modeling advances will improve predictions of nature’s contributions to people

発表者 : Kass J. M., Fukaya K.(深谷肇一), Thuiller W., Mori A.S.
掲載誌 : Trends in Ecology and Evolution (2023)
査読付き原著論文
Monitoring status and trends in genetic diversity for the Convention on Biological Diversity: An ongoing assessment of genetic indicators in nine countries

発表者 : Hoban S., da Silva J.M., Mastretta-Yanes A., Grueber C.E., Heuertz M., Hunter M.E., Mergeay J., Paz-Vinas I., Fukaya K.(深谷肇一), Ishihama F.(石濱史子), Jordan R., Koppa V., Latorre-Cardenas M.C., MacDonald A.J., Rincon-Parra V., Sjogren-Gulve P., Tani N., Thurfjell H., Laikre L.
掲載誌 : Conservation Letters, 16(3): (2023)
総説・解説
生物多様性ビッグデータに基づいたネイチャーの可視化：その現状と展望

発表者 : 久保田康裕, 楠本聞太郎, 塩野貴之, 五十里翔吾, 深谷肇一, 高科直, 吉川友也, 重藤優太郎, 新保仁, 竹内彰一, 三枝祐輔, 小森理
掲載誌 : 計量生物学, 43:145-188 (2023)
査読付き原著論文
Bird carcass detection from integrated trials at multiple wind farms

発表者 : Kitano M., Smallwood K.S., Fukaya K.(深谷肇一)
掲載誌 : Journal of Wildlife Management (2022)
査読付き原著論文
Inferring causal impacts of extreme water-level drawdowns on lake water clarity using long-term monitoring data

発表者 : Nakanishi K.(中西康介), Yokomizo H.(横溝裕行), Fukaya K.(深谷肇一), Kadoya T.(角谷拓), Matsuzaki S.(松崎慎一郎), Nishihiro J.(西廣淳), Kohzu A.(高津文人), Hayashi T.(林岳彦)
掲載誌 : Science of The Total Environment, 838(2): (2022)
Bayesian state-space SCM for deforestation baseline estimation for forest carbon credit

発表者 : Takahata K., Suetsugu H., Fukaya K.(深谷肇一), Shirota S.
掲載誌 : NeurIPS 2022 Workshop on Tackling Climate Change with Machine Learning (2022)
総説・解説
マクロ生物調査のための環境DNA分析-種の検出と定量およびその他の応用における可能性と課題-

発表者 : 深谷肇一
掲載誌 : 全国環境研会誌, 47(4):159-165 (2022)
書籍
−

発表者 : 深谷肇一, 飯島勇人, 伊東宏樹, 奥田武弘, 長田穣, 川森愛, 柴田泰宙, 木俊, 辰巳晋一, 仁科一哉, 深澤圭太, 正木隆
掲載誌 : 生態学のための階層モデリング-RとBUGSによる分布・個体数量・種の豊かさの統計解析- (2021)
査読付き原著論文
Projecting future changes in element concentrations of approximately 100 untreated discharges from legacy mines in Japan by a hierarchical log-linear model

発表者 : Iwasaki Y., Fukaya K.(深谷肇一), Fuchida S., Matsumoto S., Araoka D., Tokoro C., Yasutaka T.
掲載誌 : Science of The Total Environment (2021)
査読付き原著論文
Multispecies site occupancy modelling and study design for spatially replicated environmental DNA metabarcoding

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一), Kondo N.(今藤夏子), Matsuzaki S.(松崎慎一郎), Kadoya T.(角谷拓)
掲載誌 : Methods in Ecology and Evolution (2021)
査読付き原著論文
Integrating multiple sources of ecological data to unveil macroscale species abundance

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一), Kusumoto B., Shiono T., Fujinuma J., Kubota Y.
掲載誌 : Nature Communications, 11:1695 (2020)
査読付き原著論文
Estimating fish population abundance by integrating quantitative data on environmental DNA and hydrodynamic modelling

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一), Murakami H., Yoon S., Minami K., Osada Y., Yamamoto S., Masuda R., Kasai A., Miyashita K., Minamoto T., Kondoh M.
掲載誌 : Molecular Ecology (2020)
査読付き原著論文
A self-excited threshold autoregressive state-space model for menstrual cycles: Forecasting menstruation and identifying within-cycle stages based on basal body temperature

発表者 : Kawamori A., Fukaya K.(深谷肇一), Kitazawa M., Ishiguro M.
掲載誌 : Statistics in Medicine, 38(12):2157-2170 (2019)
査読付き原著論文
Evaluation of detection probabilities at the water-filtering and initial PCR steps in environmental DNA metabarcoding using a multispecies site occupancy model

発表者 : Doi H., Fukaya K.(深谷肇一), Oka S., Sato K., Kondoh M., Miya M.
掲載誌 : Scientific Reports, 9:3581 (2019)
査読付き原著論文
Role of wetlands in mitigating the tradeoff between crop production and water quality in agricultural landscapes

発表者 : Matsuzaki S.(松崎慎一郎), Kohzu A.(高津文人), Kadoya T.(角谷拓), Watanabe Mirai.(渡邊未来), Osawa T., Komatsu K.(小松一弘), Kondo N.(今藤夏子), Yamaguchi H.(山口晴代), Ando H.(安藤温子), Shimotori K.(霜鳥孝一), Fukaya K.(深谷肇一), Nakagawa M.(中川惠), Kizuka T., Yoshioka A.(吉岡明良), Sasai T., Saigusa N.(三枝信子), Matsushita B., Takamura N.(高村典子)
掲載誌 : Ecosphere, 10(11):e02918 (2019)
書籍
第11章分類アプローチと機械学習システム. 第12章ブースティングとバギングによるアプローチ

発表者 : 楠本聞太郎, 久保田康裕, 小森理, 三枝祐輔, 佐藤恵里, 塩野貴之, 鈴木智之, 須藤健二, 田中崇行, 比嘉基紀, 深谷肇一, 藤沼潤一
掲載誌 : 野生生物の生息適地と分布モデリング-Rプログラムによる実践-, 187-201 203-217 (2019)

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The scale-variant interstage flow makes biological insights possible: A response to Hinrichsen

発表者 : Yokomizo H.(横溝裕行), Fukaya K.(深谷肇一), Lambrinos J.G., Takada T.
掲載誌 : Journal of Ecology, 113(6):1458-1460 (2025)
Changes of cyprinid fishery resources in Lake Biwa over 57 years: association with multiple stressors and restoration measures

発表者 : Matsuzaki S.(松崎慎一郎), Fukaya K.(深谷肇一), Mabuchi K.(馬渕浩司), Kikkko T., Takamura N.
掲載誌 : Oecologia, 207(121): (2025)
occumb: An R package for site occupancy modeling of eDNA metabarcoding data

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一), Hasebe Y.
掲載誌 : Population Ecology (2025)
Optimizing Environmental DNA Metabarcoding of Archived Suspended Particulate Matter for River Biodiversity Monitoring

発表者 : Schütz R., Fukaya K.(深谷肇一), Beermann A.J. , Díaz C., Lenz A.-C., Macher T.-H., Koschorreck J., Leese F.
掲載誌 : Environmental DNA, 7(4):e70130 (2025)
Bayesian state-space synthetic control method for deforestation baseline estimation for forest carbon credits

発表者 : Takahata K., Suetsugu H., Fukaya K.(深谷肇一), Shirota S.
掲載誌 : Environmental Data Science, 3:e6 (2024)
Interstage flow matrices: Population statistic derived from matrix population models

発表者 : Yokomizo H.(横溝裕行), Fukaya K.(深谷肇一), Lambrinos J.G., Kawai Y., Takada T.
掲載誌 : Journal of Ecology, 112:1326-1338 (2024)
Albatrosses employ orientation and routing strategies similar to yacht racers

発表者 : Goto Y., Weimerskirch H., Fukaya K.(深谷肇一), Yoda K., Naruoka M., Sato K.
掲載誌 : Proceedings of the National Academy of Sciences, 121(23):e2312851121 (2024)
UAV-based height measurement and height-diameter model integrating taxonomic effects: exploring vertical structure of aboveground biomass and species diversity in a Malaysian tropical forest

発表者 : Takeuchi Y.(竹内やよい), Borjigin H., Niiyama K., Sato T., Fukaya K.(深谷肇一), Okuda T., Hayashi M. , Omar H., Norizan A.M.
掲載誌 : Environmental Research: Ecology, 2(3): (2023)
Monitoring status and trends in genetic diversity for the Convention on Biological Diversity: An ongoing assessment of genetic indicators in nine countries

発表者 : Hoban S., da Silva J.M., Mastretta-Yanes A., Grueber C.E., Heuertz M., Hunter M.E., Mergeay J., Paz-Vinas I., Fukaya K.(深谷肇一), Ishihama F.(石濱史子), Jordan R., Koppa V., Latorre-Cardenas M.C., MacDonald A.J., Rincon-Parra V., Sjogren-Gulve P., Tani N., Thurfjell H., Laikre L.
掲載誌 : Conservation Letters, 16(3): (2023)
Bird carcass detection from integrated trials at multiple wind farms

発表者 : Kitano M., Smallwood K.S., Fukaya K.(深谷肇一)
掲載誌 : Journal of Wildlife Management (2022)
Inferring causal impacts of extreme water-level drawdowns on lake water clarity using long-term monitoring data

発表者 : Nakanishi K.(中西康介), Yokomizo H.(横溝裕行), Fukaya K.(深谷肇一), Kadoya T.(角谷拓), Matsuzaki S.(松崎慎一郎), Nishihiro J.(西廣淳), Kohzu A.(高津文人), Hayashi T.(林岳彦)
掲載誌 : Science of The Total Environment, 838(2): (2022)
Projecting future changes in element concentrations of approximately 100 untreated discharges from legacy mines in Japan by a hierarchical log-linear model

発表者 : Iwasaki Y., Fukaya K.(深谷肇一), Fuchida S., Matsumoto S., Araoka D., Tokoro C., Yasutaka T.
掲載誌 : Science of The Total Environment (2021)
Multispecies site occupancy modelling and study design for spatially replicated environmental DNA metabarcoding

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一), Kondo N.(今藤夏子), Matsuzaki S.(松崎慎一郎), Kadoya T.(角谷拓)
掲載誌 : Methods in Ecology and Evolution (2021)
Integrating multiple sources of ecological data to unveil macroscale species abundance

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一), Kusumoto B., Shiono T., Fujinuma J., Kubota Y.
掲載誌 : Nature Communications, 11:1695 (2020)
Estimating fish population abundance by integrating quantitative data on environmental DNA and hydrodynamic modelling

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一), Murakami H., Yoon S., Minami K., Osada Y., Yamamoto S., Masuda R., Kasai A., Miyashita K., Minamoto T., Kondoh M.
掲載誌 : Molecular Ecology (2020)
A self-excited threshold autoregressive state-space model for menstrual cycles: Forecasting menstruation and identifying within-cycle stages based on basal body temperature

発表者 : Kawamori A., Fukaya K.(深谷肇一), Kitazawa M., Ishiguro M.
掲載誌 : Statistics in Medicine, 38(12):2157-2170 (2019)
Evaluation of detection probabilities at the water-filtering and initial PCR steps in environmental DNA metabarcoding using a multispecies site occupancy model

発表者 : Doi H., Fukaya K.(深谷肇一), Oka S., Sato K., Kondoh M., Miya M.
掲載誌 : Scientific Reports, 9:3581 (2019)
Role of wetlands in mitigating the tradeoff between crop production and water quality in agricultural landscapes

発表者 : Matsuzaki S.(松崎慎一郎), Kohzu A.(高津文人), Kadoya T.(角谷拓), Watanabe Mirai.(渡邊未来), Osawa T., Komatsu K.(小松一弘), Kondo N.(今藤夏子), Yamaguchi H.(山口晴代), Ando H.(安藤温子), Shimotori K.(霜鳥孝一), Fukaya K.(深谷肇一), Nakagawa M.(中川惠), Kizuka T., Yoshioka A.(吉岡明良), Sasai T., Saigusa N.(三枝信子), Matsushita B., Takamura N.(高村典子)
掲載誌 : Ecosphere, 10(11):e02918 (2019)

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Biodiversity modeling advances will improve predictions of nature’s contributions to people

発表者 : Kass J. M., Fukaya K.(深谷肇一), Thuiller W., Mori A.S.
掲載誌 : Trends in Ecology and Evolution (2023)
生物多様性ビッグデータに基づいたネイチャーの可視化：その現状と展望

発表者 : 久保田康裕, 楠本聞太郎, 塩野貴之, 五十里翔吾, 深谷肇一, 高科直, 吉川友也, 重藤優太郎, 新保仁, 竹内彰一, 三枝祐輔, 小森理
掲載誌 : 計量生物学, 43:145-188 (2023)
マクロ生物調査のための環境DNA分析-種の検出と定量およびその他の応用における可能性と課題-

発表者 : 深谷肇一
掲載誌 : 全国環境研会誌, 47(4):159-165 (2022)

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−

発表者 : 深谷肇一
掲載誌 : 生態学のための標本抽出法 (2023)
−

発表者 : 深谷肇一, 飯島勇人, 伊東宏樹, 奥田武弘, 長田穣, 川森愛, 柴田泰宙, 木俊, 辰巳晋一, 仁科一哉, 深澤圭太, 正木隆
掲載誌 : 生態学のための階層モデリング-RとBUGSによる分布・個体数量・種の豊かさの統計解析- (2021)
第11章分類アプローチと機械学習システム. 第12章ブースティングとバギングによるアプローチ

発表者 : 楠本聞太郎, 久保田康裕, 小森理, 三枝祐輔, 佐藤恵里, 塩野貴之, 鈴木智之, 須藤健二, 田中崇行, 比嘉基紀, 深谷肇一, 藤沼潤一
掲載誌 : 野生生物の生息適地と分布モデリング-Rプログラムによる実践-, 187-201 203-217 (2019)

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研究成果（口頭）

all
研究発表
研究講演

研究発表
Towards a broader assessment of national biodiversity trends: dynamic occupancy modelling of shorebird communities in Japan

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一), Uehira K., Moriya T., Amano T., Senzaki M., Shimizu T., Kadoya T.(角谷拓)
学会等名称 : 32nd International Congress for Conservation Biology (ICCB 2025) (2025)
予稿集名 : Abstracts
研究発表
Rパッケージ開発の要点

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 第72回日本生態学会大会 (2025)
予稿集名 : 同予稿集
研究発表
日本の里地里山の生物多様性の危機

発表者 : 石井実, 藤田卓, 福田真由子, 小林彩, 赤坂宗光, 内田圭, 片山直樹, 曽我昌史, 深谷肇一, 久野真純, 松島野枝
学会等名称 : 第72回日本生態学会大会 (2025)
予稿集名 : 同予稿集
研究講演
環境DNAメタバーコーディングにおける種の検出可能性の評価と研究デザインへの示唆

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 第40回全国環境研究所交流シンポジウム (2025)
予稿集名 : 同予稿集
ボランティア調査員による全国モニタリングに基づく個体群トレンド指標の構築

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : シンポジウムネイチャーポジティブを測る：国レベルの指標構築にむけて (2025)
予稿集名 : なし
研究発表
Comparative demographic analysis using new population statistics: inter-stage flow matrix and reproductive-value flow matrix.

発表者 : Yokomizo H.(横溝裕行), Fukaya K.(深谷肇一), Lambrinos J.G., Takada T.
学会等名称 : The 9th annual meeting of Evolutionary Demography Society (2024)
予稿集名 : -
研究発表
The R package occumb for Bayesian inference of multispecies site occupancy models for eDNA

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一), Hasebe Y.
学会等名称 : International Statistical Ecology Conference (ISEC) 2024 (2024)
予稿集名 : Abstracts
研究発表
環境DNAメタバーコーディングデータの統計解析のためのRパッケージの開発と適用

発表者 : 深谷肇一, 長谷部勇太
学会等名称 : 第71回日本生態学会大会 (2024)
予稿集名 : 同予稿集
研究発表
長期的な生息地変化と生物多様性トレンドの統合：日本の沿岸性水鳥の事例

発表者 : 清水孟彦, 先崎理之, 深谷肇一, 天野達也, 角谷拓, 守屋年史, 上平健太郎
学会等名称 : 第71回日本生態学会大会 (2024)
予稿集名 : 同予稿集
研究発表
Predicting and mapping ecosystem services using biodiversity models and remote sensing data

発表者 : Kass J., Fukaya K.(深谷肇一), Thuiller W., Mori A.
学会等名称 : 第71回日本生態学会大会 (2024)
予稿集名 : Abstracts
研究発表
岩礁潮間帯2種系において種間相互作用の環境依存性

発表者 : 姚遠, 深谷肇一, 野田隆史
学会等名称 : 第71回日本生態学会大会 (2024)
予稿集名 : 同予稿集
研究発表
都市公園木の枝葉上の動物群集に対する園内の花と景観の効果の検証

発表者 : 池本美都, 深谷肇一, 鈴木佑弥, 今藤夏子, 角谷拓
学会等名称 : 第71回日本生態学会大会 (2024)
予稿集名 : 同予稿集
研究発表
Towards even more efficient biodiversity monitoring through eDNA metabarcoding: an approach based on site occupancy modeling

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一), Kondo N.(今藤夏子), Matsuzaki S.(松崎慎一郎), Kadoya T.(角谷拓)
学会等名称 : ISM Symposium on Environmental Statistics 2024 (2024)
予稿集名 : Abstracts
研究発表
環境DNAメタバーコーディングにおける種の不完全な検出：その特性と対処法

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 第7回環境DNA学会つくば大会 (2024)
予稿集名 : 同予稿集
研究講演
環境DNAメタバーコーディングによる不完全な検出を考慮した種分布・多様性評価

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 麻布大学セミナー (2024)
予稿集名 : なし
研究発表
Overview of FDS-NIES collaborative research on Forest Volume Modeling Using UAV-Derived Metrics and Permanent Sample Plots Data

発表者 : Takeuchi Y.(竹内やよい), Fukaya K.(深谷肇一), Sato T., Estoque R.C., Nakamura S.(中村省吾), Ooba M., Toyama H., Suyama Y., Borjigin H.
学会等名称 : BILATERAL COLLABORATION RESEARCH TOWARDS SUSTAINABLE FOREST MANAGEMENT IN SARAWAK (2024)
予稿集名 : ABSTRACT, 7
研究発表
広域・長期モニタリングデータに基づく日本のシギ・チドリ類の占有率トレンドの評価

発表者 : 深谷肇一, 上平健太郎, 守屋年史, 天野達也, 先崎理之, 清水孟彦, 角谷拓
学会等名称 : 2023年度統計関連学会連合大会 (2023)
予稿集名 : 同予稿集, 304
研究発表
Predicting ecosystem functions and services in space and time with biodiversity models

発表者 : Kass J.M., Fukaya K.(深谷肇一), Thuiller W., Mori A.
学会等名称 : The 10th East Asia Federation of Ecological Societies (EAFES) International Congress (2023)
予稿集名 : Abstracts
研究発表
Environmental DNA metabarcoding of benthic invertebrates in riverine environments: a model-based assessment of species detectability for optimized study design

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一), Hasebe Y.
学会等名称 : The eDNA Society International Meeting 2023 (2023)
予稿集名 : Abstracts
研究発表
Horizontal and vertical distribution of environmental DNA of jack mackerel Trachurus japonicus and Japanese anchovy Engraulis japonicus in Maizuru Bay, Kyoto Prefecture

発表者 : Murakami H., Fukaya K.(深谷肇一), Yamamoto S., Minamoto T., Minami K., Miyashita K., Kameoka T., Masuda R., Yamashita Y., Kondoh M.
学会等名称 : The eDNA Society International Meeting 2023 (2023)
予稿集名 : Abstracts
研究発表
遺伝的多様性指標の観点から見た種分布・種個体数評価の現状と課題

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 日本生態学会第70回大会 (2023)
予稿集名 : 同予稿集
研究発表
シギ・チドリ類の国内における占有状態に関するトレンド評価

発表者 : 上平健太郎, 守屋年史, 角谷拓, 深谷肇一
学会等名称 : 日本生態学会第70回大会 (2023)
予稿集名 : 同予稿集
研究発表
occumb：多種サイト占有モデルを用いた環境DNAメタバーコーディングデータ解析のためのRパッケージ

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 第6回環境DNA学会九州大会 (2023)
予稿集名 : 同予稿集
研究講演
生物多様性観測：蓄積されたデータの活用と観測手法の発展

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : GBIFワークショップ21正規の生物多様性研究（通算第18回）「今、必要とされている生物多様性観測」 (2023)
予稿集名 : 同予稿集
研究発表
長期・広域の生態系モニタリングのモデル化：種多様性の変化を推測する

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 統計思考院人材育成事業ワークショップ「生物多様性と群集動態：定量化の数理と統計的推定法」 (2023)
予稿集名 : なし
研究発表
Site occupancy modeling for environmental DNA metabarcoding

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一)
学会等名称 : Quantitative Ecological Modeling for Biodiversity, Conservation, and Management (2023)
予稿集名 : -
研究発表
状態空間モデリング：個体群モニタリングにおける方法と話題

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 第39回個体群生態学会大会 (2023)
予稿集名 : 同予稿集
研究発表
風力発電所における統合調査に基づく風車への衝突個体の発見率

発表者 : 北野雅人, Smallwood K.S., 深谷肇一
学会等名称 : 環境アセスメント学会第21回大会 (2022)
予稿集名 : 同予稿集
研究講演
生態学における階層モデルの応用

発表者 : 深谷肇一, 伊東宏樹
学会等名称 : 2022年度統計関連学会連合大会 (2022)
予稿集名 : 同予稿集
研究講演
環境DNAメタバーコーディングによる種多様性評価のモデル化：不完全な検出を考慮した統計推測と調査デザイン

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 統計数理研究所共同利用研究集会「諸科学における統計思考」 (2022)
予稿集名 : なし
研究発表
A hierarchical modeling approach for environmental DNA metabarcoding: inference of species detection process, site occupancy, and study design

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一), Kondo N.(今藤夏子), Matsuzaki S.(松崎慎一郎), Kadoya T.(角谷拓)
学会等名称 : International Statistical Ecology Conference (ISEC) 2022 (2022)
予稿集名 : Abstracts
研究発表
生態学的ビッグデータと統計モデリングによる生物多様性評価の高度化

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 第69回日本生態学会大会 (2022)
予稿集名 : 同予稿集
研究発表
多種サイト占有モデルを用いた環境DNA分析における調査デザインの最適化

発表者 : 松本岳大, 深谷肇一, 坂田雅之, 沖津二朗, 稲川崇史, 平岡康介, 一柳英隆, 源利文
学会等名称 : 第69回日本生態学会大会 (2022)
予稿集名 : 同予稿集
研究発表
Context dependence of population dynamics in rocky intertidal sessile assembly: using intrinsic growth grate as a proxy of environmental suitability

発表者 : Yao Y., Fukaya K.(深谷肇一), Noda T.
学会等名称 : 第69回日本生態学会大会 (2022)
予稿集名 : Abstracts
研究発表
個体の流れ行列を用いて栄養繁殖を行う個体群の特徴を理解する

発表者 : 横溝裕行, John Lambrinos, 深谷肇一, 高田壮則
学会等名称 : 日本生態学会第69回全国大会 (2022)
予稿集名 : 同予稿集
研究発表
繁殖価の流れ行列による在来種と外来種の比較

発表者 : 横溝裕行, 深谷肇一, John Lambrinos, 高田壮則
学会等名称 : 日本生態学会第69回全国大会 (2022)
予稿集名 : 同予稿集
研究発表
琵琶湖の透明度上昇に対する大渇水の因果効果の推定

発表者 : 中西康介, 横溝裕行, 深谷肇一, 角谷拓, 松崎慎一郎, 西廣淳, 高津文人, 林岳彦
学会等名称 : 日本生態学会第69回全国大会 (2022)
予稿集名 : 同予稿集
研究発表
Bayesian state-space SCM for deforestation baseline estimation for forest carbon credit

発表者 : Takahata K., Suetsugu H., Fukaya K.(深谷肇一), Shirota S.
学会等名称 : NeurIPS 2022 Workshop on Tackling Climate Change with Machine Learning (2022)
予稿集名 : Abstracts
研究講演
環境DNA分析による生態系評価の高度化：統計モデリングによるアプローチ

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 統計数理研究所共同利用研究集会「生物統計と数理生物：似ているようで異なる生物へのアプローチ」 (2022)
予稿集名 : なし
研究講演
環境DNA分析に基づく種の個体数量と多様性の評価：統計モデリングによる最近の発展

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : ダーウィンセミナー (2022)
予稿集名 : なし
研究発表
Projecting future changes in element concentrations of approximately 100 untreated discharges from legacy mines in Japan by a hierarchical log-linear model

発表者 : Iwasaki Y., Fukaya K.(深谷肇一), Fuchida S., Matsumoto S., Araoka D., Tokoro C., Yasutaka T.
学会等名称 : SETAC 2021 Australia Conference (2021)
予稿集名 : Abstracts, 53
研究講演
Integrating multiple sources of ecological data to estimate species abundance of woody plants at geographic scales

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一), Kusumoto B., Shiono T., Fujinuma J., Kubota Y.
学会等名称 : 2021 WNAR/IMS/JR Annual Meeting (2021)
予稿集名 : Abstracts, 67
研究発表
個体の流れ行列と繁殖価の流れ行列による在来種と外来種の比較

発表者 : 横溝裕行, 深谷肇一, John Lambrinos, 高田壮則
学会等名称 : 第68回日本生態学会大会 (2021)
予稿集名 : 同予稿集
研究発表
階層モデリングをデータ解析と調査設計に活用する

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 第68回日本生態学会大会 (2021)
予稿集名 : なし
研究発表
2種系動態の環境依存性を理解する新しい枠組み：岩礁潮間帯固着生物群集の事例研究

発表者 : 姚遠, 深谷肇一, 野田隆史
学会等名称 : 第68回日本生態学会大会 (2021)
予稿集名 : なし
研究発表
ダム湖において環境DNAメタバーコーディング手法を用いる際の最適採水地点数の検討

発表者 : 松本岳大, 深谷肇一, 坂田雅之, 稲川崇史, 沖津二朗, 平岡康介, 一柳英隆, 源利文
学会等名称 : 第68回日本生態学会大会 (2021)
予稿集名 : なし
研究講演
生態学における観測・推測・予測と統計モデリング

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 第68回日本生態学会大会 (2021)
予稿集名 : なし
研究講演
階層モデリングによるデータ統合：地理的スケールでの種個体数量分布の推定

発表者 : 深谷肇一, 楠本聞太郎, 塩野貴之, 藤沼潤一, 久保田康裕
学会等名称 : 第132回日本森林学会大会シンポジウム (2021)
予稿集名 : 同予稿集
研究講演
Toward a better biodiversity assessment based on environmental DNA: a statistical modeling approach

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一)
学会等名称 : ECO seminar (2021)
予稿集名 : -
研究発表
環境DNAメタバーコーディングにおける種検出誤差を考慮した階層モデリングとその実践

発表者 : 深谷肇一, 今藤夏子, 松崎慎一郎, 角谷拓
学会等名称 : 環境DNA学会第4回大会 (2021)
予稿集名 : 同予稿集, 21-22
研究発表
ダム湖の魚類調査における環境DNAメタバーコーディング分析の実装に向けて

発表者 : 松本岳大, 深谷肇一, 坂田雅之, 沖津二朗, 稲川崇史, 平岡康介, 一柳英隆, 源利文
学会等名称 : 環境DNA学会第4回大会 (2021)
予稿集名 : 同予稿集, 29-30
研究発表
Modeling future changes in element concentrations of 99 untreated discharges from legacy mines in Japan by a hierarchical log-linear model

発表者 : Iwasaki Y., Fukaya K.(深谷肇一), Fuchida S., Matsumoto S., Araoka D., Tokoro C., Yasutaka T.
学会等名称 : SETAC North America 42nd Annual Meeting (2021)
予稿集名 : Abstracts, 303
研究発表
環境DNAによる生物多様性評価のための階層モデルとベイズ決定分析

発表者 : 深谷肇一, 今藤夏子, 松崎慎一郎, 角谷拓
学会等名称 : 科学研究費シンポジウム予測モデリングの理論と応用 (2021)
予稿集名 : 同予稿集
研究講演
環境DNA分析に基づく個体数の推定

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : リモセン虎の穴セミナー (2020)
予稿集名 : なし
研究発表
個体の流れ行列：新たな個体群基本統計量により植物個体群の特徴を明らかにする

発表者 : 横溝裕行, 深谷肇一, John Lambrinos, 川合由加, 高田壮則
学会等名称 : 第三回デモグラファー会議 (2020)
予稿集名 : 同予稿集
研究発表
植物個体群の生態学的特徴を知るための新たな個体群統計量:個体の流れ行列

発表者 : 横溝裕行, 深谷肇一, John Lambrinos, 川合由加, 高田壮則
学会等名称 : 第36回個体群生態学会大会 (2020)
予稿集名 : 同予稿集
研究講演
生物多様性の理解におけるプレストン不備の解決に向けて

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 環境DNA学会第3回大会第36回個体群生態学会大会合同大会 (2020)
予稿集名 : 同予稿集
研究発表
系統樹ガウス過程因子モデルとディリクレ過程によるクラスタリングを用いた結合型種分布モデル

発表者 : 城田慎一郎, 深谷肇一, 吉川徹朗
学会等名称 : 2019年度統計関連学会連合大会 (2019)
予稿集名 : 同予稿集
研究発表
環境DNAメタバーコーディングにおける検出誤差を踏まえた種分布・多様性評価

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 研究集会「生態データ統計モデルの包括的推進：個体群・群集・行動」 (2019)
予稿集名 : なし
研究発表
Inter stage flow matrix: a new population statistic in ecological risk assessment

発表者 : Yokomizo H.(横溝裕行), Fukaya K.(深谷肇一), Lambrinos J.G., Kawai Y., Takada T.
学会等名称 : 第25回（2019年）日本環境毒性学会研究発表会 (2019)
予稿集名 : Abstract, 72
研究発表
Inter-stage flow matrix as a population statistic for comparative plant demography

発表者 : Yokomizo H.(横溝裕行), Fukaya K.(深谷肇一), Lambrinos J.G., Kawai Y., Takada T.
学会等名称 : 第35回個体群生態学会大会 (2019)
予稿集名 : Abstracts
研究講演
環境DNA分析による個体数の推定

発表者 : 深谷肇一, 村上弘章, 尹錫鎭, 南憲吏, 長田穣, 山本哲史, 益田玲爾, 笠井亮秀, 宮下和志, 源利文, 近藤倫生
学会等名称 : 日本進化学会第21回大会 (2019)
予稿集名 : 同予稿集, 77
研究発表
環境省モニタリングサイト1000沿岸域調査（磯・千潟・アマモ場・藻場）10年のまとめ

発表者 : 青木美鈴, 仲岡雅裕, 野田隆史, 本村泰三, 田中義幸, 阿部拓三, 太齋彰浩, 青木優和, 鈴木孝男, 早川淳, 金谷弦, 深谷肇一, 多留聖典, 飯島明子, 村田明久, 田中次郎, 白山義久, 山北剛久, 栗原健夫, 坂西芳, 島袋寛盛, 浜口昌巳, 堀正和, 吉田吾郎, 木村妙子, 倉島彰, 向井宏, 石田惣, 古賀庸憲, 川井浩史, 村瀬昇, 逸見泰久, 森敬介, 寺田竜太, 山本智子, 岸本和雄, 環境省生物多様性センター
学会等名称 : ⽇本⽣態学会第66回全国⼤会 (2019)
予稿集名 : 同予稿集
研究発表
植物個体群の個体と繁殖価の流れ：個体群行列データベースCOMPADREを用いた解析

発表者 : 横溝裕行, 深谷肇一, Lambrinos John, 高田壮則
学会等名称 : 日本生態学会第66回全国大会 (2019)
予稿集名 : 同予稿集
研究講演
Integrating multiple sources of ecological data to estimate abundance of a number of species at geographic scales

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一)
学会等名称 : ISM Symposium on Environmental Statistics 2019 (2019)
予稿集名 : -
研究発表
多変量計数データの多種サイト占有モデリングと環境DNAメタバーコーディングへの応用

発表者 : 深谷肇一, 今藤夏子, 角谷拓
学会等名称 : 第66回日本生態学会大会 (2019)
予稿集名 : 同予稿集
研究発表
湿地調査における環境DNAの活用と課題

発表者 : 今藤夏子, 平野佑奈, 木寺法子, 深谷肇一, 角谷拓, 松崎慎一郎
学会等名称 : 日本生態学会第66回大会 (2019)
予稿集名 : 同予稿集
研究発表
生態過程と観測過程のモデル化：応用生態学のための階層モデル

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 第67回日本生態学会大会 (2019)
予稿集名 : 同予稿集
研究講演
環境DNAメタバーコーディングのための多種サイト占有モデルとサンプリングデザインの最適化

発表者 : 深谷肇一, 今藤夏子, 角谷拓
学会等名称 : 中央水研・国環研交流シンポジウム（つくばE3セミナー）「数理・統計モデルを用いて環境保全・資源管理の問題を検討する」 (2019)
予稿集名 : なし
研究講演
マクロスケールの種個体数分布：種多様性の起源と保全への示唆

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 進化生態こまば教室 (2019)
予稿集名 : なし
研究発表
検出誤差に頑健な環境DNAメタバーコーディング：種分布・多様性の評価と研究デザインの最適化

発表者 : 深谷肇一, 今藤夏子, 角谷拓
学会等名称 : 第2回環境DNA学会神戸大会 (2019)
予稿集名 : 同予稿集, 14
研究発表
環境DNAの基礎的情報の必要性と展望定量的アプローチの視点から

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 第2回環境DNA学会神戸大会 (2019)
予稿集名 : 同予稿集
研究発表
Comparative demography among four functional groups based on elasticity and inter-stage flows of individuals

発表者 : Yokomizo H.(横溝裕行), Fukaya K.(深谷肇一), Lambrinos J., Kawai Y., Takada T.
学会等名称 : Sixth Annual Meeting of the Evolutionary Demography Society (2019)
予稿集名 : -
研究発表
風力発電所のバードストライクに影響するマルチスケールの環境要因

発表者 : 北野雅人, 谷津繁芳, 深谷肇一
学会等名称 : 日本鳥学会2018年度大会 (2018)
予稿集名 : 同予稿集, 18
研究発表
二値検出データと地理分布データの統合による生態群集の広域個体数推定

発表者 : 深谷肇一, 楠本聞太郎, 塩野貴之, 藤沼潤一, 久保田康裕
学会等名称 : 2018年度統計関連学会連合大会 (2018)
予稿集名 : 同予稿集, 97
研究発表
環境DNA濃度の定量データと流動モデルの統合による個体数・生物量の推定

発表者 : 深谷肇一, 村上弘章, 尹錫鎭, 南憲吏, 長田穣, 山本哲史, 益田玲爾, 笠井亮秀, 宮下和士, 源利文, 近藤倫生
学会等名称 : 第1回環境DNA学会東京大会 (2018)
予稿集名 : 同予稿集, 17
研究講演
Macroscale estimation of species abundance distributions: a practical advancement and an implication for evolutionary underpinnings of biodiversity

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一)
学会等名称 : 関東地区会公開シンポジウム「多様性の成り立ちと機能」 (Symposium for Kanto Branch of Ecological Society of Japan “Biodiversity: Structure and Function”) (2018)
予稿集名 : -
研究講演
個体数推定のための統計モデルが明らかにする木本種の多様性と生物地理

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 蟲の日セミナー (2018)
予稿集名 : -
研究講演
広域の種個体数分布と生物多様性の進化的基盤

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : リモセン虎の穴セミナー (2018)
予稿集名 : -
研究発表
生態学的大規模データを統合する階層モデル-種個体数分布の広域予測-

発表者 : 深谷肇一, 楠本聞太郎, 塩野貴之, 藤沼潤一, 久保田康裕
学会等名称 : 科学研究費シンポジウム予測モデリングとその周辺ー機械学習・統計科学・情報理論からのアプローチー (2018)
予稿集名 : 同予稿集
研究講演
マルコフモデルによる群集動態の推測：推移確率・状態の不確実性・密度依存性

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 第34回個体群生態学会大会 (2018)
予稿集名 : 同予稿集, 21
研究発表
Analysis of flow matrices describing inter-stage flows of individuals using randomly generated population matrices

発表者 : Yokomizo H.(横溝裕行), Fukaya K.(深谷肇一), Lambrinos J.G., Takada T,
学会等名称 : 第34回個体群生態学会 (2018)
予稿集名 : Abstracts, 34

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Towards a broader assessment of national biodiversity trends: dynamic occupancy modelling of shorebird communities in Japan

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一), Uehira K., Moriya T., Amano T., Senzaki M., Shimizu T., Kadoya T.(角谷拓)
学会等名称 : 32nd International Congress for Conservation Biology (ICCB 2025) (2025)
予稿集名 : Abstracts
Rパッケージ開発の要点

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 第72回日本生態学会大会 (2025)
予稿集名 : 同予稿集
日本の里地里山の生物多様性の危機

発表者 : 石井実, 藤田卓, 福田真由子, 小林彩, 赤坂宗光, 内田圭, 片山直樹, 曽我昌史, 深谷肇一, 久野真純, 松島野枝
学会等名称 : 第72回日本生態学会大会 (2025)
予稿集名 : 同予稿集
Comparative demographic analysis using new population statistics: inter-stage flow matrix and reproductive-value flow matrix.

発表者 : Yokomizo H.(横溝裕行), Fukaya K.(深谷肇一), Lambrinos J.G., Takada T.
学会等名称 : The 9th annual meeting of Evolutionary Demography Society (2024)
予稿集名 : -
The R package occumb for Bayesian inference of multispecies site occupancy models for eDNA

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一), Hasebe Y.
学会等名称 : International Statistical Ecology Conference (ISEC) 2024 (2024)
予稿集名 : Abstracts
長期的な生息地変化と生物多様性トレンドの統合：日本の沿岸性水鳥の事例

発表者 : 清水孟彦, 先崎理之, 深谷肇一, 天野達也, 角谷拓, 守屋年史, 上平健太郎
学会等名称 : 第71回日本生態学会大会 (2024)
予稿集名 : 同予稿集
Predicting and mapping ecosystem services using biodiversity models and remote sensing data

発表者 : Kass J., Fukaya K.(深谷肇一), Thuiller W., Mori A.
学会等名称 : 第71回日本生態学会大会 (2024)
予稿集名 : Abstracts
Towards even more efficient biodiversity monitoring through eDNA metabarcoding: an approach based on site occupancy modeling

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一), Kondo N.(今藤夏子), Matsuzaki S.(松崎慎一郎), Kadoya T.(角谷拓)
学会等名称 : ISM Symposium on Environmental Statistics 2024 (2024)
予稿集名 : Abstracts
環境DNAメタバーコーディングにおける種の不完全な検出：その特性と対処法

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 第7回環境DNA学会つくば大会 (2024)
予稿集名 : 同予稿集
Overview of FDS-NIES collaborative research on Forest Volume Modeling Using UAV-Derived Metrics and Permanent Sample Plots Data

発表者 : Takeuchi Y.(竹内やよい), Fukaya K.(深谷肇一), Sato T., Estoque R.C., Nakamura S.(中村省吾), Ooba M., Toyama H., Suyama Y., Borjigin H.
学会等名称 : BILATERAL COLLABORATION RESEARCH TOWARDS SUSTAINABLE FOREST MANAGEMENT IN SARAWAK (2024)
予稿集名 : ABSTRACT, 7
広域・長期モニタリングデータに基づく日本のシギ・チドリ類の占有率トレンドの評価

発表者 : 深谷肇一, 上平健太郎, 守屋年史, 天野達也, 先崎理之, 清水孟彦, 角谷拓
学会等名称 : 2023年度統計関連学会連合大会 (2023)
予稿集名 : 同予稿集, 304
Predicting ecosystem functions and services in space and time with biodiversity models

発表者 : Kass J.M., Fukaya K.(深谷肇一), Thuiller W., Mori A.
学会等名称 : The 10th East Asia Federation of Ecological Societies (EAFES) International Congress (2023)
予稿集名 : Abstracts
遺伝的多様性指標の観点から見た種分布・種個体数評価の現状と課題

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 日本生態学会第70回大会 (2023)
予稿集名 : 同予稿集
長期・広域の生態系モニタリングのモデル化：種多様性の変化を推測する

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 統計思考院人材育成事業ワークショップ「生物多様性と群集動態：定量化の数理と統計的推定法」 (2023)
予稿集名 : なし
Site occupancy modeling for environmental DNA metabarcoding

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一)
学会等名称 : Quantitative Ecological Modeling for Biodiversity, Conservation, and Management (2023)
予稿集名 : -
状態空間モデリング：個体群モニタリングにおける方法と話題

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 第39回個体群生態学会大会 (2023)
予稿集名 : 同予稿集
風力発電所における統合調査に基づく風車への衝突個体の発見率

発表者 : 北野雅人, Smallwood K.S., 深谷肇一
学会等名称 : 環境アセスメント学会第21回大会 (2022)
予稿集名 : 同予稿集
A hierarchical modeling approach for environmental DNA metabarcoding: inference of species detection process, site occupancy, and study design

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一), Kondo N.(今藤夏子), Matsuzaki S.(松崎慎一郎), Kadoya T.(角谷拓)
学会等名称 : International Statistical Ecology Conference (ISEC) 2022 (2022)
予稿集名 : Abstracts
生態学的ビッグデータと統計モデリングによる生物多様性評価の高度化

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 第69回日本生態学会大会 (2022)
予稿集名 : 同予稿集
Context dependence of population dynamics in rocky intertidal sessile assembly: using intrinsic growth grate as a proxy of environmental suitability

発表者 : Yao Y., Fukaya K.(深谷肇一), Noda T.
学会等名称 : 第69回日本生態学会大会 (2022)
予稿集名 : Abstracts
繁殖価の流れ行列による在来種と外来種の比較

発表者 : 横溝裕行, 深谷肇一, John Lambrinos, 高田壮則
学会等名称 : 日本生態学会第69回全国大会 (2022)
予稿集名 : 同予稿集
Bayesian state-space SCM for deforestation baseline estimation for forest carbon credit

発表者 : Takahata K., Suetsugu H., Fukaya K.(深谷肇一), Shirota S.
学会等名称 : NeurIPS 2022 Workshop on Tackling Climate Change with Machine Learning (2022)
予稿集名 : Abstracts
Projecting future changes in element concentrations of approximately 100 untreated discharges from legacy mines in Japan by a hierarchical log-linear model

発表者 : Iwasaki Y., Fukaya K.(深谷肇一), Fuchida S., Matsumoto S., Araoka D., Tokoro C., Yasutaka T.
学会等名称 : SETAC 2021 Australia Conference (2021)
予稿集名 : Abstracts, 53
階層モデリングをデータ解析と調査設計に活用する

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 第68回日本生態学会大会 (2021)
予稿集名 : なし
環境DNAによる生物多様性評価のための階層モデルとベイズ決定分析

発表者 : 深谷肇一, 今藤夏子, 松崎慎一郎, 角谷拓
学会等名称 : 科学研究費シンポジウム予測モデリングの理論と応用 (2021)
予稿集名 : 同予稿集
個体の流れ行列：新たな個体群基本統計量により植物個体群の特徴を明らかにする

発表者 : 横溝裕行, 深谷肇一, John Lambrinos, 川合由加, 高田壮則
学会等名称 : 第三回デモグラファー会議 (2020)
予稿集名 : 同予稿集
系統樹ガウス過程因子モデルとディリクレ過程によるクラスタリングを用いた結合型種分布モデル

発表者 : 城田慎一郎, 深谷肇一, 吉川徹朗
学会等名称 : 2019年度統計関連学会連合大会 (2019)
予稿集名 : 同予稿集
環境DNAメタバーコーディングにおける検出誤差を踏まえた種分布・多様性評価

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 研究集会「生態データ統計モデルの包括的推進：個体群・群集・行動」 (2019)
予稿集名 : なし
植物個体群の個体と繁殖価の流れ：個体群行列データベースCOMPADREを用いた解析

発表者 : 横溝裕行, 深谷肇一, Lambrinos John, 高田壮則
学会等名称 : 日本生態学会第66回全国大会 (2019)
予稿集名 : 同予稿集
多変量計数データの多種サイト占有モデリングと環境DNAメタバーコーディングへの応用

発表者 : 深谷肇一, 今藤夏子, 角谷拓
学会等名称 : 第66回日本生態学会大会 (2019)
予稿集名 : 同予稿集
湿地調査における環境DNAの活用と課題

発表者 : 今藤夏子, 平野佑奈, 木寺法子, 深谷肇一, 角谷拓, 松崎慎一郎
学会等名称 : 日本生態学会第66回大会 (2019)
予稿集名 : 同予稿集
生態過程と観測過程のモデル化：応用生態学のための階層モデル

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 第67回日本生態学会大会 (2019)
予稿集名 : 同予稿集
環境DNAの基礎的情報の必要性と展望定量的アプローチの視点から

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 第2回環境DNA学会神戸大会 (2019)
予稿集名 : 同予稿集
Comparative demography among four functional groups based on elasticity and inter-stage flows of individuals

発表者 : Yokomizo H.(横溝裕行), Fukaya K.(深谷肇一), Lambrinos J., Kawai Y., Takada T.
学会等名称 : Sixth Annual Meeting of the Evolutionary Demography Society (2019)
予稿集名 : -
二値検出データと地理分布データの統合による生態群集の広域個体数推定

発表者 : 深谷肇一, 楠本聞太郎, 塩野貴之, 藤沼潤一, 久保田康裕
学会等名称 : 2018年度統計関連学会連合大会 (2018)
予稿集名 : 同予稿集, 97
生態学的大規模データを統合する階層モデル-種個体数分布の広域予測-

発表者 : 深谷肇一, 楠本聞太郎, 塩野貴之, 藤沼潤一, 久保田康裕
学会等名称 : 科学研究費シンポジウム予測モデリングとその周辺ー機械学習・統計科学・情報理論からのアプローチー (2018)
予稿集名 : 同予稿集
環境DNAメタバーコーディングデータの統計解析のためのRパッケージの開発と適用

発表者 : 深谷肇一, 長谷部勇太
学会等名称 : 第71回日本生態学会大会 (2024)
予稿集名 : 同予稿集
岩礁潮間帯2種系において種間相互作用の環境依存性

発表者 : 姚遠, 深谷肇一, 野田隆史
学会等名称 : 第71回日本生態学会大会 (2024)
予稿集名 : 同予稿集
都市公園木の枝葉上の動物群集に対する園内の花と景観の効果の検証

発表者 : 池本美都, 深谷肇一, 鈴木佑弥, 今藤夏子, 角谷拓
学会等名称 : 第71回日本生態学会大会 (2024)
予稿集名 : 同予稿集
Environmental DNA metabarcoding of benthic invertebrates in riverine environments: a model-based assessment of species detectability for optimized study design

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一), Hasebe Y.
学会等名称 : The eDNA Society International Meeting 2023 (2023)
予稿集名 : Abstracts
Horizontal and vertical distribution of environmental DNA of jack mackerel Trachurus japonicus and Japanese anchovy Engraulis japonicus in Maizuru Bay, Kyoto Prefecture

発表者 : Murakami H., Fukaya K.(深谷肇一), Yamamoto S., Minamoto T., Minami K., Miyashita K., Kameoka T., Masuda R., Yamashita Y., Kondoh M.
学会等名称 : The eDNA Society International Meeting 2023 (2023)
予稿集名 : Abstracts
シギ・チドリ類の国内における占有状態に関するトレンド評価

発表者 : 上平健太郎, 守屋年史, 角谷拓, 深谷肇一
学会等名称 : 日本生態学会第70回大会 (2023)
予稿集名 : 同予稿集
occumb：多種サイト占有モデルを用いた環境DNAメタバーコーディングデータ解析のためのRパッケージ

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 第6回環境DNA学会九州大会 (2023)
予稿集名 : 同予稿集
多種サイト占有モデルを用いた環境DNA分析における調査デザインの最適化

発表者 : 松本岳大, 深谷肇一, 坂田雅之, 沖津二朗, 稲川崇史, 平岡康介, 一柳英隆, 源利文
学会等名称 : 第69回日本生態学会大会 (2022)
予稿集名 : 同予稿集
個体の流れ行列を用いて栄養繁殖を行う個体群の特徴を理解する

発表者 : 横溝裕行, John Lambrinos, 深谷肇一, 高田壮則
学会等名称 : 日本生態学会第69回全国大会 (2022)
予稿集名 : 同予稿集
琵琶湖の透明度上昇に対する大渇水の因果効果の推定

発表者 : 中西康介, 横溝裕行, 深谷肇一, 角谷拓, 松崎慎一郎, 西廣淳, 高津文人, 林岳彦
学会等名称 : 日本生態学会第69回全国大会 (2022)
予稿集名 : 同予稿集
個体の流れ行列と繁殖価の流れ行列による在来種と外来種の比較

発表者 : 横溝裕行, 深谷肇一, John Lambrinos, 高田壮則
学会等名称 : 第68回日本生態学会大会 (2021)
予稿集名 : 同予稿集
2種系動態の環境依存性を理解する新しい枠組み：岩礁潮間帯固着生物群集の事例研究

発表者 : 姚遠, 深谷肇一, 野田隆史
学会等名称 : 第68回日本生態学会大会 (2021)
予稿集名 : なし
ダム湖において環境DNAメタバーコーディング手法を用いる際の最適採水地点数の検討

発表者 : 松本岳大, 深谷肇一, 坂田雅之, 稲川崇史, 沖津二朗, 平岡康介, 一柳英隆, 源利文
学会等名称 : 第68回日本生態学会大会 (2021)
予稿集名 : なし
環境DNAメタバーコーディングにおける種検出誤差を考慮した階層モデリングとその実践

発表者 : 深谷肇一, 今藤夏子, 松崎慎一郎, 角谷拓
学会等名称 : 環境DNA学会第4回大会 (2021)
予稿集名 : 同予稿集, 21-22
ダム湖の魚類調査における環境DNAメタバーコーディング分析の実装に向けて

発表者 : 松本岳大, 深谷肇一, 坂田雅之, 沖津二朗, 稲川崇史, 平岡康介, 一柳英隆, 源利文
学会等名称 : 環境DNA学会第4回大会 (2021)
予稿集名 : 同予稿集, 29-30
Modeling future changes in element concentrations of 99 untreated discharges from legacy mines in Japan by a hierarchical log-linear model

発表者 : Iwasaki Y., Fukaya K.(深谷肇一), Fuchida S., Matsumoto S., Araoka D., Tokoro C., Yasutaka T.
学会等名称 : SETAC North America 42nd Annual Meeting (2021)
予稿集名 : Abstracts, 303
植物個体群の生態学的特徴を知るための新たな個体群統計量:個体の流れ行列

発表者 : 横溝裕行, 深谷肇一, John Lambrinos, 川合由加, 高田壮則
学会等名称 : 第36回個体群生態学会大会 (2020)
予稿集名 : 同予稿集
Inter stage flow matrix: a new population statistic in ecological risk assessment

発表者 : Yokomizo H.(横溝裕行), Fukaya K.(深谷肇一), Lambrinos J.G., Kawai Y., Takada T.
学会等名称 : 第25回（2019年）日本環境毒性学会研究発表会 (2019)
予稿集名 : Abstract, 72
Inter-stage flow matrix as a population statistic for comparative plant demography

発表者 : Yokomizo H.(横溝裕行), Fukaya K.(深谷肇一), Lambrinos J.G., Kawai Y., Takada T.
学会等名称 : 第35回個体群生態学会大会 (2019)
予稿集名 : Abstracts
環境省モニタリングサイト1000沿岸域調査（磯・千潟・アマモ場・藻場）10年のまとめ

発表者 : 青木美鈴, 仲岡雅裕, 野田隆史, 本村泰三, 田中義幸, 阿部拓三, 太齋彰浩, 青木優和, 鈴木孝男, 早川淳, 金谷弦, 深谷肇一, 多留聖典, 飯島明子, 村田明久, 田中次郎, 白山義久, 山北剛久, 栗原健夫, 坂西芳, 島袋寛盛, 浜口昌巳, 堀正和, 吉田吾郎, 木村妙子, 倉島彰, 向井宏, 石田惣, 古賀庸憲, 川井浩史, 村瀬昇, 逸見泰久, 森敬介, 寺田竜太, 山本智子, 岸本和雄, 環境省生物多様性センター
学会等名称 : ⽇本⽣態学会第66回全国⼤会 (2019)
予稿集名 : 同予稿集
検出誤差に頑健な環境DNAメタバーコーディング：種分布・多様性の評価と研究デザインの最適化

発表者 : 深谷肇一, 今藤夏子, 角谷拓
学会等名称 : 第2回環境DNA学会神戸大会 (2019)
予稿集名 : 同予稿集, 14
風力発電所のバードストライクに影響するマルチスケールの環境要因

発表者 : 北野雅人, 谷津繁芳, 深谷肇一
学会等名称 : 日本鳥学会2018年度大会 (2018)
予稿集名 : 同予稿集, 18
環境DNA濃度の定量データと流動モデルの統合による個体数・生物量の推定

発表者 : 深谷肇一, 村上弘章, 尹錫鎭, 南憲吏, 長田穣, 山本哲史, 益田玲爾, 笠井亮秀, 宮下和士, 源利文, 近藤倫生
学会等名称 : 第1回環境DNA学会東京大会 (2018)
予稿集名 : 同予稿集, 17
Analysis of flow matrices describing inter-stage flows of individuals using randomly generated population matrices

発表者 : Yokomizo H.(横溝裕行), Fukaya K.(深谷肇一), Lambrinos J.G., Takada T,
学会等名称 : 第34回個体群生態学会 (2018)
予稿集名 : Abstracts, 34

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環境DNAメタバーコーディングによる不完全な検出を考慮した種分布・多様性評価

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 麻布大学セミナー (2024)
予稿集名 : なし
生態学における階層モデルの応用

発表者 : 深谷肇一, 伊東宏樹
学会等名称 : 2022年度統計関連学会連合大会 (2022)
予稿集名 : 同予稿集
環境DNAメタバーコーディングによる種多様性評価のモデル化：不完全な検出を考慮した統計推測と調査デザイン

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 統計数理研究所共同利用研究集会「諸科学における統計思考」 (2022)
予稿集名 : なし
環境DNA分析による生態系評価の高度化：統計モデリングによるアプローチ

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 統計数理研究所共同利用研究集会「生物統計と数理生物：似ているようで異なる生物へのアプローチ」 (2022)
予稿集名 : なし
環境DNA分析に基づく種の個体数量と多様性の評価：統計モデリングによる最近の発展

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : ダーウィンセミナー (2022)
予稿集名 : なし
Integrating multiple sources of ecological data to estimate species abundance of woody plants at geographic scales

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一), Kusumoto B., Shiono T., Fujinuma J., Kubota Y.
学会等名称 : 2021 WNAR/IMS/JR Annual Meeting (2021)
予稿集名 : Abstracts, 67
生態学における観測・推測・予測と統計モデリング

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 第68回日本生態学会大会 (2021)
予稿集名 : なし
階層モデリングによるデータ統合：地理的スケールでの種個体数量分布の推定

発表者 : 深谷肇一, 楠本聞太郎, 塩野貴之, 藤沼潤一, 久保田康裕
学会等名称 : 第132回日本森林学会大会シンポジウム (2021)
予稿集名 : 同予稿集
Toward a better biodiversity assessment based on environmental DNA: a statistical modeling approach

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一)
学会等名称 : ECO seminar (2021)
予稿集名 : -
環境DNA分析に基づく個体数の推定

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : リモセン虎の穴セミナー (2020)
予稿集名 : なし
生物多様性の理解におけるプレストン不備の解決に向けて

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 環境DNA学会第3回大会第36回個体群生態学会大会合同大会 (2020)
予稿集名 : 同予稿集
環境DNA分析による個体数の推定

発表者 : 深谷肇一, 村上弘章, 尹錫鎭, 南憲吏, 長田穣, 山本哲史, 益田玲爾, 笠井亮秀, 宮下和志, 源利文, 近藤倫生
学会等名称 : 日本進化学会第21回大会 (2019)
予稿集名 : 同予稿集, 77
Integrating multiple sources of ecological data to estimate abundance of a number of species at geographic scales

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一)
学会等名称 : ISM Symposium on Environmental Statistics 2019 (2019)
予稿集名 : -
環境DNAメタバーコーディングのための多種サイト占有モデルとサンプリングデザインの最適化

発表者 : 深谷肇一, 今藤夏子, 角谷拓
学会等名称 : 中央水研・国環研交流シンポジウム（つくばE3セミナー）「数理・統計モデルを用いて環境保全・資源管理の問題を検討する」 (2019)
予稿集名 : なし
マクロスケールの種個体数分布：種多様性の起源と保全への示唆

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 進化生態こまば教室 (2019)
予稿集名 : なし
Macroscale estimation of species abundance distributions: a practical advancement and an implication for evolutionary underpinnings of biodiversity

発表者 : Fukaya K.(深谷肇一)
学会等名称 : 関東地区会公開シンポジウム「多様性の成り立ちと機能」 (Symposium for Kanto Branch of Ecological Society of Japan “Biodiversity: Structure and Function”) (2018)
予稿集名 : -
個体数推定のための統計モデルが明らかにする木本種の多様性と生物地理

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 蟲の日セミナー (2018)
予稿集名 : -
広域の種個体数分布と生物多様性の進化的基盤

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : リモセン虎の穴セミナー (2018)
予稿集名 : -
マルコフモデルによる群集動態の推測：推移確率・状態の不確実性・密度依存性

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 第34回個体群生態学会大会 (2018)
予稿集名 : 同予稿集, 21
環境DNAメタバーコーディングにおける種の検出可能性の評価と研究デザインへの示唆

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : 第40回全国環境研究所交流シンポジウム (2025)
予稿集名 : 同予稿集
生物多様性観測：蓄積されたデータの活用と観測手法の発展

発表者 : 深谷肇一
学会等名称 : GBIFワークショップ21正規の生物多様性研究（通算第18回）「今、必要とされている生物多様性観測」 (2023)
予稿集名 : 同予稿集

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委員会活動

2018年度 : モニタリングサイト1000里地調査検討委員会委員 (環境省自然環境局生物多様性センター)
2019年度 : モニタリングサイト1000里地調査検討委員会委員 (環境省自然環境局生物多様性センター)
2025年度 : 令和7年度モニタリングサイト1000 里地調査検討会委員 (環境省生物多様性センター)
2024年度 : 統計数理研究所客員教員（生物多様性評価のための統計モデリング） (情報・システム研究機構　統計数理研究所)
2024年度 : 2024年度リーディングDAT L-B講座「統計ﾓﾃﾞﾘﾝｸﾞ入門」講師 (情報・システム研究機構　統計数理研究所)
2024年度 : 環境省「令和6年度重要生態系監視地域モニタリング推進事業（磯・干潟調査）」有識者 (環境省自然環境局)
2024年度 : 令和6年度モニタリングサイト1000里地調査検討会委員 (環境省生物多様性センター)
2024年度 : 令和6年度一般社団法人日本生態学会大会企画委員 (一般社団法人日本生態学会)
2023年度 : 成蹊大学集中講義（Society5.0における生物多様性保全（仮））講師 (成蹊大学)
2023年度 : 一般社団法人環境DNA学会　第7回大会実行委員 (一般社団法人環境DNA学会)
2023年度 : 個体群生態学会　理事兼専務理事 (個体群生態学会)
2023年度 : モニタリングサイト1000里地調査検討会および解析ワーキンググループ委員 (環境省自然環境局)
2023年度 : 2023年度リーディング DAT L‐B 講座「統計モデリング入門」講師 (情報・システム研究機構)
2023年度 : 環境省「令和５年度重要生態系監視地域モニタリング推進事業（磯・干潟調査）」有識者 (環境省自然環境局)
2023年度 : 一般社団法人日本生態学会　大会実行委員 (一般社団法人日本生態学会)
2023年度 : 一般社団法人日本生態学会　大会企画委員 (一般社団法人日本生態学会)
2023年度 : 一般社団法人日本生態学会　情報交流支援専門委員 (一般社団法人日本生態学会)
2022年度 : 令和5年度非常勤講師（生態統計学）　 (国立大学法人東京大学)
2022年度 : 科学技術専門家ネットワーク・専門調査員 (文部科学省科学技術予測・政策基盤調査研究センター)
2022年度 : 2022年度統計関連学会連合大会のチュートリアルセッション講師 (成蹊大学)
2022年度 : 科学技術専門家ネットワーク・専門調査員 (文部科学省科学技術予測・政策基盤調査研究センター)
2022年度 : モニタリングサイト1000里地調査検討会委員 (環境省自然環境局生物多様性センター)
2022年度 : 令和4年度重要生態系監視地域モニタリング推進事業(磯・干潟調査)有識者 (環境省自然環境局)
2021年度 : 2021年度リーディングDAT L-B1講座講師（統計モデリング入門） (情報・システム研究機構　統計数理研究所)
2021年度 : 令和３年度非常勤講師（生態統計学） (東京大学農学部)
2021年度 : モニタリング1000里地調査検討会委員 (環境省自然環境局生物多様性センター)
2020年度 : モニタリングサイト1000里地調査検討委員会委員 (環境省自然環境局生物多様性センター)
2020年度 : 環境DNA 技術標準化・一般化検討会委員 (環境省自然環境局生物多様性センター)

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国立環境研究所について

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