- 予算区分
- AQ センター調査研究
- 研究課題コード
- 1515AQ006
- 開始/終了年度
- 2015~2015年
- キーワード(日本語)
- ゲノム配列決定,シアノバクテリア,アオコ
- キーワード(英語)
- genome sequencing, cyanobacteria, algal bloom
研究概要
Planktothrix属は世界的にもアオコの原因となっており、浮遊性で有毒物質を産生して問題となっている。Planktothrix属の中で、霞ヶ浦で優占していると考えられる種はPlanktothrix agardhiiで、そのタイプ株は霞ヶ浦で採取されたNIES-204株である。Planktothrix属のゲノム情報の整備は、アオコ発生の遺伝的要因解明に繋がると考え、本研究においてタイプ株であるNIES-204株の全ゲノム配列決定と遺伝的特徴の解明に取り組む。
研究の性格
- 主たるもの:モニタリング・研究基盤整備
- 従たるもの:基礎科学研究
全体計画
国立環境研究所微生物系統保存施設に保存されているPlanktothrix agardhiiのタイプ株であるNIES-204株のゲノムを、次世代シークエンサーを用いてシークエンシングし、アノテーションを付与した状態でデータベースに登録し、一般に公開する。
今年度の研究概要
国立環境研究所微生物系統保存施設に保存されているPlanktothrix agardhiiのタイプ株であるNIES-204株のゲノムを、次世代シークエンサーを用いてシークエンシングし、アノテーションを付与した状態でデータベースに登録し、一般に公開する。
- 関連する研究課題
- 0 : 生物・生態系環境研究分野における研究課題