- 研究課題コード
- 2123CD012
- 開始/終了年度
- 2021~2023年
- キーワード(日本語)
- 水生植物,埋土種子,DNAメタバーコーディング,保全地選択,種多様性
- キーワード(英語)
- aquatic macrophyte,seed bank,DNA metabarcoding,selection of protected area,species diversity
研究概要
淡水域の堆積物中に存在する水生植物の埋土種子のDNAメタバーコーディングを行い、環境DNAにより検出された水生植物との種多様性の違いを明らかにする。得られた結果から、埋土種子の生育可能性を考慮した水生植物の保全優先地選択を行い、在来種を効果的に保全するための対策を提示する。
研究の性格
- 主たるもの:基礎科学研究
- 従たるもの:技術開発・評価
全体計画
水生植物の埋土種子の種多様性を明らかにするため、関東平野に分布する農業用ため池、湧水、公園の池、休耕田などで水生植物の埋土種子および環境DNAを採取する。埋土種子および環境DNAは、葉緑体のrbcLとtrnL領域をMiseqで解析し、種判別を行う。水生植物種ごとの埋土種子は、リファレンス作成のためのダイレクトシーケンスも行う。
各地点における埋土種子の有無のデータと生存率を用いて水生植物種ごとの絶滅リスクを計算し、埋土種子と植生のそれぞれにおいて保全優先地の選択を行う。埋土種子の有無と地上植生の有無によって保全地を選択した場合に、保全優先地に違いが見られるかどうかを明らかにする。
今年度の研究概要
休耕田や湧水において、水生植物の埋土種子の種多様性を明らかにするための埋土種子および環境DNAの採取を行う。埋土種子および環境DNAは、葉緑体のrbcLとtrnL領域をMiseqで解析し種判別を行う。
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