研究成果（平成23年度）

《研究課題コ−ド》 1115KB001

《課題名》
	Digital DNA chipによる生物多様性評価と環境予測法の開発 Development of biodiversity evaluation and environmental forecast with Digital DNA chip
《区分名》 KB JST
《担当者》
	○河地正伸（生物・生態系環境研究センター）,山口晴代
《キ−ワ−ド》
	ピコプランクトン,生物多様性,フローサイトメトリ picoplankton, biodiversity, flowcytometry
《目的》
	ピコサイズの植物プランクトンは海洋環境の基礎生産者としての重要性に加えて、進化系統的に多様性が高く、未知未培養性の種を多く含むことが知られる。東北沿岸海域のピコ植物プランクトンの多様性解明とメタゲノム情報を補完するためのレファレンスゲノムとして利用可能な培養株の確立を目的として、次の2つの研究項目に取り組む。 1）保存株の長期保存に使われている凍結保存法を現場環境試料に適用することで、現場環境の微生物多様性を長期・安定的に保存する。 2）現場環境で優占するピコ植物プランクトンを対象として、フローサイトメトリを活用した優占種の培養株確立と多様性解析を行う。
《内容及び成果》
	フローサイトメトリ(FCM)による細胞分取の条件検討と18S rDNAのクローンライブラリによる多様性解析、そして東北沿岸域での試料収集を行った。2011年3月に親潮海域で採取、凍結保存した環境試料について、FCMによる群集解析を行い、18S rDNAのクローンライブラリを作成した結果、約40種からなる182配列のうち173配列（約95%）は植物プランクトン由来の配列であり、FCMを用いて細胞を分取することで、効率よく植物プランクトンの多様性を解析できることが明らかになった。 　また、2012年2月に東北沿岸域で収集した海水試料について、培養処理および凍結保存を行い、レファレンスゲノムに資するピコサイズ植物プランクトンの培養株確立に取り組んだ。
《期間》　平成23〜平成27年度（2011〜2015年度）
《備考》