(3) 微生物系統保存施設に保存されている微細藻類株の分類学的情報の収集とデータベース化に関する研究

〔区分名〕基盤ラボ
〔研究課題コード〕０００４AD２５０
〔重点特別研究プロジェクト名，政策対応型調査・研究名〕

〔担当者〕笠井文絵（環境研究基盤技術ラボラトリー）・河地正伸・広木幹也・清水　明・志村純子
〔期　間〕平成１２〜１６年度（２０００〜２００４年度）
〔目　的〕国立環境研究所・微生物系統保存施設の公的保存機関としての役割は年々増している。一方，最近の分子生物学，生理・生化学的分析技術の進歩により，従来の形態観察では見落とされていた差異や系統的類縁関係を明らかにすることが可能になり，微生物保存施設に保存されている微細藻類株についても，新たな分類学的手法に基づいて分類学的見なおしを行い，最新の知見に基づく分類学的情報を提供していくことが求められている。このような期待に答えるため，微細藻類保存株の遺伝子情報，生理生化学的性質，形態・微細構造学的性質を調べることによって保存株の分類学的見なおしを行い，既に整理されている産地，培養条件等の基本情報とともに株情報のデータベースを作成することを目的とする。
〔内容および成果〕
　現在分子分類学的手法により見直しが行われている緑藻類を中心とした保存株の１８SrRNA遺伝子の塩基配列を解析し，類縁種との塩基配列の比較や系統解析によって種名の再確認を行う。また，これらの株の形態的特徴を光学顕微鏡，電子顕微鏡で記録し，データベースの基礎資料とする。さらに，光合成色素組成や脂肪酸組成など生理生化学的特性については測定法の確立とルーチン化を行い，それらを統合したデータベース（プロトタイプ）を作成する。緑藻類７０株あまりの保存株の１８SrRNA遺伝子の塩基配列を調べ，これらを既存の遺伝子データと比較することによって分子系統的位置の確認を行った。また，今までの分子分類学的研究に基づいた保存株の種名の変更や保存株を用いた文献収集など，保存株の分類学的見直しと株データの収集を行った。
〔備　考〕

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