| 氏 名 | 所 属 | 賞の名称 | 受賞内容 | 受賞年月日 |
| 中島 英彰 | 地球環境研究グループ | NASA（米国航空宇宙局）グループ業績賞 | 北西太平洋域における自然及び人工起源の対流圏微量気体成分の化学、輸送過程の解明のための貢献 | H12.4.5 |
| 畠山 史郎 | 大気圏環境部 | 米国地球物理学連合編集委員長表彰 | 地球物理学研究誌（大気）の著者と読者に対する貢献 | H12.5.30 |
| 水落 元之 | 地域環境研究グループ | 韓国環境保全有功者環境部長官表彰 | 韓国国立環境研究院との間で実施した国際協力事業団のプロジェクト方式技術協力「韓国水質改善システム開発プロジェクト」に対する貢献 | H12.6.5 |
| 合志 陽一 | 副所長 | 第４９回デンバーＸ線会議バークス賞 | Ｘ線分光においての研究業績、特に環境への応用、シンクロトロン放射光の利用における教育者、研究者としての永年の貢献 | H12.8.2 |
| 西川 雅高 | 地域環境研究グループ | ヨーロッパエアロゾル会議２０００
ポスター賞 | ポスター発表演題「発生源砂漠（タクラマカン砂漠を例として）で採取した砂塵系ダストの特徴」 | H12.9.7 |
| 日暮 明子 | 大気圏環境部 | 社団法人日本気象学会
山本・正野論文賞 | NOAA/AVHRRを用いた２波長全球エアロゾル解析アルゴリズムの開発 | H12.10.19 |
| 稲森 悠平 | 地域環境研究グループ | 土浦市市制施行６０周年記念表彰 | 多年にわたり市政進展に尽力したことに対する功績 | H12.11.3 |
| 杉本 伸夫 | 大気圏環境部 | 日中友好環境保護センター主任表彰 | 日中友好環境保護センターにおける黄砂の測定技術の指導に対する功績 | H13.3.16 |
