| Classification of Protozoa (T. Cavalier-Smith, 2003) (ref. ID; 4924) | ||||||||||
| Subkingdom | Infrakingdom | Superphylum | Phylum | Subphylum | Infraphylum | Superclass | Class | Subclass | Genus | |
| Sarcomastigota | Amoebozoa | Protamoebae | Breviatea | 'Mastigamoeba invertens' | ||||||
| Lobosea | Amoeba, Chaos, Saccamoeba, Hartmannella, Echinamoeba, Leptomyxa, Rhizamoeba, Copromyxa, Arcella | |||||||||
| Discosea | Vannella, Platyamoeba, Multicilia, Vexillifera, Paramoeba, Mayorella, Cochliopodium, Thecamoeba | |||||||||
| Variosea | Phalansterium, Acanthamoeba, Balamuthia, Gephyramoeba, Filamoeba, Stereomyxa | |||||||||
| Conosa | Archamoebae | Archamoeba | Pelomyxa, Mastigina, Entamoeba, Mastigamoeba, Phreatamoeba, Endolimax | |||||||
| Mycetozoa | Stelamoebea | Protostelium, Schizoplasmodium, Cavostelium, Planoprotostelium, Acytostelium, Dictyostelium | ||||||||
| Myxogastrea | Hyperamoeba, Ceratiomyxa, Stemonitis, Physarum, Didymium | |||||||||
| Choanozoa | Choanoflagellatea | Monosiga | ||||||||
| Corallochytrea | Corallochytrium | |||||||||
| Ichthyosporea | Dermocystidium, Ichthyophonus | |||||||||
| Cristidiscoidea | Ministeria, Nuclearia | |||||||||
| Biciliata | Rhizaria | Cercozoa | Filosa | Reticulofilosa | Chlorarachnea | Chlorarachnion, Bigelowiella, Lotharella, Cryptochlora, Gymnochlora | ||||
| Proteomyxidea | Pseudospora, Leucodictyon, Reticulamoeba, Massisteria, Dimorpha, Gymnophrys, Borkovia | |||||||||
| Monadofilosa | Sarcomonadea | Cercomonas, Heteromita, Bodomorpha, Proleptomonas, Allantion | ||||||||
| Thecofilosea | Cryptodifflugia, Cryothecomonas | |||||||||
| Spongomonadea | Spongomonas, Rhipidodendron | |||||||||
| Imbricatea | Thaumatomonas, Thaumatomastix, Allas, Gyromitus, Euglypha, Trinema, Paulinella | |||||||||
| Endomyxa | Phytomyxea | Phagomyxa, Plasmodiophora | ||||||||
| Ascetosporea | Minchinia, Haplosporidium, Urosporidium, Bonamia, Marteilia, Paramyxa, Paramarteilia, Claustrosporidium, Microcytos | |||||||||
| Gromiidea | ||||||||||
| Retaria | Radiozoa | Acantharea | Acanthometra | |||||||
| Sticholonchea | Sticholonche | |||||||||
| Polycystinea | Collozoum | |||||||||
| Foraminifera | Athalamea | Reticulomyxa | ||||||||
| Polythalamea | Allogromia, Textularia, Globigerina, Miliola | |||||||||
| Xenophyophorea | Psammina | |||||||||
| Excavata | Loukozoa | Jakobea | Reclinomonas, Histiona, Jakoba | |||||||
| Malawimonadea | Malawimonas | |||||||||
| Metamonada | Anaeromonada | Anaeromonadea | Trimastix | |||||||
| Trichozoa | Parabasalia | Trichomonadea | Trichomonas, Lophomonas, Microjoenia, Spirotrichonympha | |||||||
| Trichonymphea | ||||||||||
| Carpediemonadia | Carpediemonadea | Carpediemonas | ||||||||
| Eopharyngia | Trepomonadea | Diplozoa | Trepomonas, Hexamita, Spironucleus, Giardia, Octomitus | |||||||
| Enteromonadia | Enteromonas | |||||||||
| Retortamonadea | Retortamonas, Chilomastix | |||||||||
| Discicristata | Percolozoa | Heterolobosea | Naegleria, Tetramitus, Vahlkampfia, Lyromonas, Psalteriomonas | |||||||
| Percolatea | Percolomonas, Stephanopogon | |||||||||
| Euglenozoa | Plicostoma | Euglenoidea | Petalomonas, Peranema, Rhabdomonas, Euglena, Astasia, Eutreptia, Trachelomonas | |||||||
| Diplonemea | Diplonema, Rhynchopus | |||||||||
| Saccostoma | Kinetoplastea | Bodo, Rhynchomonas, Ichthyobodo, Trypanosoma, Crithidia, Leishmania | ||||||||
| Postgaardea | Postgaardi, Calkinsia | |||||||||
| Alveolata | Miozoa | Protalvelata | Colponemea | Colponema | ||||||
| Perkinsea | Perkinsus | |||||||||
| Dinozoa | Ellobiopsa | Ellobiopsea | Ellobiopsis, Thalassomyces | |||||||
| Dinoflagellata | Syndina | Syndinea | Amoebophrya | |||||||
| Dinokaryota | Noctilucea | Noctiluca | ||||||||
| Peridinea | Peridinium, Prorocentrum, Haplozoon, Dinophysis, Ceratium, Crypthecodinium, Symbiodinium, Polarella, Oxyrrhis | |||||||||
| Apicomplexa | Apicomonada | Apicomonadea | Acrocoelus, Parvilucifera, Colpodella | |||||||
| Sporozoa | Coccidea | Hepatozoon, Cryptosporidium, Toxoplasma | ||||||||
| Gregarinea | Monocystis, Ophriocystis | |||||||||
| Hematozoa | Plasmodium, Babesia, Theileria | |||||||||
| Ciliophora | Postciliodesmatophora | Karyorelictea | Kentrophoros, Tracheloraphis, Loxodes | |||||||
| Heterotrichea | Stentor, Folliculina, Blepharisma | |||||||||
| Intramacornucleata | Spirotrichea | Oxytricha, Euplotes, Tintinnus, Metopus | ||||||||
| Litostomatea | Didinium, Lacrymaria, Entodinium | |||||||||
| Phyllopharyngea | Dysteria, Podophrya | |||||||||
| Colpodea | Colpoda | |||||||||
| Nassophorea | Nassula | |||||||||
| Prostomatea | Coleps | |||||||||
| Plagiophylea | ||||||||||
| Oligohymenophorea | Tetrahymena, Paramecium, Vorticella | |||||||||